Évolution de la divergence de niche et de l'isolement reproductif dans deux radiations de plantes néotropicales

Responsable : Mathieu Perret

Étudiante : Alice Padlewski (masterante)

Collaboratrices internes : Camille Christe, Régine Niba & Michelle Price

Programme : Systématique et évolution des Gesneriaceae

Description du projet

Ce projet vie à comprendre les processus macroévolutifs qui contribuent à l’origine et au maintien de la diversité des Gesneriaceae dans la forêt atlantique brésilienne (BAF), un point chaud majeur de la biodiversité sur Terre. L’étude portera sur deux lignées endémiques de la BAF, le clade Codonanthe-Nematanthus et les Ligeriinae, qui présentent une diversité écologique et phénotypique exceptionnelle. Pour atteindre cet objectif, nous assemblerons les séquences d’ADN disponibles et compléterons l’échantillonnage moléculaire et taxonomique dans des groupes sélectionnés pour produire des phylogénies complètes calibrées dans le temps. Sur la base de ce cadre historique, nous reconstruirons les taux de diversification de différents traits fonctionnels associés à la spécialisation de la pollinisation (pour les colibris, les abeilles et les chauves-souris), au micro-habitat (saxicoles vs épiphytes) et aux préférences climatiques. En particulier, nous testerons lesquels de ces axes de niche jouent un rôle prédominant dans le stade précoce de la diversification des espèces avant l’établissement de barrières reproductives postzygotiques intrinsèques. Nous nous attendons à ce que la comparaison de la dynamique évolutive le long de ces différents axes et clades de niche puisse aider à élucider la séquence probable d’événements de diversification qui conduisent à des groupes d’espèces phénotypiquement divers.

Objectifs scientifiques

Ce projet vise à explorer la question suivante : dans quelle mesure la diversification écologique au cours du rayonnement adaptatif suit-elle des étapes prévisibles ? Pour répondre à cette question nous allons :

  • Développer une phylogénie complète au niveau des espèces pour les Gesneriaceae brésiliennes sur la base des données génomiques et des séquences de Sanger (A2.2)
  • Assembler et compléter un grand ensemble de données de traits fonctionnels décrivant le mode de pollinisation, les préférences d’habitat et la niche climatique de chaque espèce (B1.2, B1.4)
  • Utilisez la phylogénie pour déduire le taux d’évolution dans le temps de ces traits fonctionnels et le rythme auquel les barrières postzygotiques intrinsèques et l’isolement géographique sont atteints (A2.3)
  • Comparez les résultats entre deux lignées indépendantes pour détecter des modèles communs (A2.4)
  • Communiquer et publier les résultats (C1.1)
  • Former une botaniste aux approches modernes de l’étude de la biodiversité (C4.2)

Les objectifs scientifiques s’intègrent dans le cadre de la stratégie scientifique de l’institution qui définit les trois axes de recherche majeurs (A, B, C) des CJBG. Les abréviations (A2.2, B1.2, etc.) font références aux objectifs prioritaires visés par les objectifs scientifiques de ce programme.

Publications associées

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