PhyloLab

Une personne pipette une solution dans de petits tubes pour des analyses génétiques.

Responsable : Dr Mathieu Perret

Le but du laboratoire est de comprendre l’évolution de la biodiversité des plantes et champignons à partir de l’analyse de données génétiques et génomiques. Les activités de recherches sont menées tant au niveau interspécifique, avec les approches phylogénétiques, qu’intraspécifique, avec les outils de la génétique des populations et de la phylogéographie.

Nos résultats permettent de reconstruire l’histoire évolutive des plantes et des champignons (arbre du vivant), d’améliorer leur classification et d’expliquer l’origine de leur extraordinaire diversité.

Techniques utilisées dans notre laboratoire :

  • Extraction d’ADN à partir d’échantillons d’herbier ou frais
  • Préparation de librairies génomique et capture de gènes pour le séquençage de nouvelle génération (NGS)
  • Amplification par PCR et séquençage d’ADN Sanger
  • Mise au point de marqueurs microsatellites et génotypages
  • Clonage de fragments d’ADN
Équipement

Le laboratoire est équipé d’un séquenceur automatique (GenomeLab GeXP™ Genetic Analysis System) permettant également l’analyse de fragments d’ADN (microsatellites, AFLP, SNP), d’un analyseur de fragments ADN, de réflectomètre et fluorimètre pour quantifier l’ADN, d’un sonicateur d’ADN, de plusieurs appareils PCR et PCR quantitative (Corbett RotorGene) et de tout l’équipement classique d’un laboratoire de biologie moléculaire.

Formation universitaire et professionnelle

Le laboratoire accueille des étudiants de l’Universités de Genève dans le cadre de travaux de doctorat/postdoctorat ou de Master (orientation « Biodiversité et Systématique »), ainsi que des étudiants d’autres institutions suisses ou internationales.

Le laboratoire forme également des apprentis laborantins en biologie (CFC) en lien avec l’AGEMEL.

Publications

Consulter la liste complète des publications de l’équipe du PhyloLab

Publications 2010-2024 (PDF)

Equipe

Mathieu Perret, conservateur 
Yamama Naciri, conservatrice
Camille Christe, adjointe scientifique
Charles Pouchon, adjoint scientifique
Régine Niba, laborantine
Lourdes Candini, laborantine auxiliaire
Fabrice Jaquet, apprenti laborantin
Elodie Marques-Filipe, apprentie laborantine
Sébastien Miche, assistant doctorant UniGe